Airbyte ELT パイプラインで FHIR のデータに接続

Airbyte は、データウェアハウス、データレイク、データベースなど、あらゆるデータストアにデータをロードできる強力なツールです。CData Connect AI と組み合わせることで、Airbyte ユーザーはリアルタイムの FHIR のデータ から直接 Extract, Load, Transform（ELT）パイプラインを作成できます。本記事では、Connect AI を通じて FHIR に接続し、Airbyte 内で FHIR のデータ の ELT パイプラインを構築する手順を説明します。

CData Connect AI は FHIR 専用の SQL Server インターフェースを提供し、ネイティブデータベースへのデータレプリケーションを行うことなくデータをクエリできます。最適化されたデータ処理機能を内蔵しており、フィルタや JOIN を含むサポート対象のすべての SQL 操作を FHIR に直接転送します。これにより、サーバーサイド処理を活用して目的の FHIR のデータ を高速に取得できます。

Airbyte 用に FHIR への接続を構成

Airbyte から FHIR への接続は、CData Connect AI を介して実現します。Airbyte で FHIR のデータ を利用するには、まず FHIR 接続を作成・設定します。

1. Connect AI にログインし、Sources をクリックして、 Add Connection をクリックします

2. Add Connection パネルから「FHIR」を選択します

3. FHIR に接続するために必要な認証プロパティを入力します。

   URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。

   汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。

   Service Base URL のサンプル

   • 汎用：http://my_fhir_server/r4b/
   • Azure：https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
   • AWS：https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
   • Google：https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/

   汎用FHIR インスタンス

   CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います（OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください）。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。

   
4. Save & Test をクリックします
5. Add FHIR Connection ページの Permissions タブに移動し、ユーザーベースの権限を更新します。

パーソナルアクセストークンの追加

REST API、OData API、または仮想 SQL Server を介して Connect AI に接続する際、パーソナルアクセストークン（PAT）を使用して Connect AI への接続を認証します。アクセスの粒度を維持するために、サービスごとに個別の PAT を作成することをお勧めします。

1. Connect AI アプリの右上にある歯車アイコン（）をクリックして設定ページを開きます。
2. Settings ページで Access Tokens セクションに移動し、 Create PAT をクリックします。
3. PAT に名前を付けて Create をクリックします。
4. パーソナルアクセストークンは作成時にのみ表示されます。必ずコピーして、将来の使用に備えて安全な場所に保存してください。

接続の設定と PAT の生成が完了したら、Airbyte から FHIR のデータ に接続する準備が整いました。

Airbyte から FHIR に接続

Airbyte から CData Connect AI への接続を確立するには、以下の手順に従います。

1. Airbyte アカウントにログインします
2. 左側のパネルで Sources をクリックし、Add New Source をクリックします
   • Source Type を MSSQL Server に設定して TDS エンドポイントに接続します
   • Source Name を設定します
   • Host URL を tds.cdata.com に設定します
   • Port を 14333 に設定します
   • Database を事前に設定した接続名（例：FHIR1）に設定します
   • Username を Connect AI のユーザー名に設定します
   • SSL Method を Encrypted (trust server certificate) に設定し、Replication Method は標準のまま、SSH Tunnel Method を No Tunnel に設定します
   • （オプション）Schema にソースに適用したい値を設定します
   • Password を Connect AI の PAT に設定します
   • （オプション）必要な JDBC URL パラメータを入力します
3. Test and Save をクリックしてデータソースを作成します。

FHIR のデータ用の ELT パイプラインを作成

FHIR のデータ を新しい同期先に接続するには、Sources をクリックし、Set Up Connection をクリックして同期先に接続します。上記で作成したソースと目的の同期先を選択し、Airbyte の処理が完了するまで待ちます。完了すると、接続が使用可能になります。

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