DataGrip で FHIR のデータ をクエリ

DataGrip は、SQL 開発者がデータベースへのクエリ、作成、管理を行えるデータベース IDE です。CData JDBC Driver for FHIR と組み合わせることで、DataGrip からリアルタイムFHIR のデータを操作できます。この記事では、DataGrip で FHIR のデータ への接続を確立方法を説明します。

FHIR 用の新しいドライバー定義を作成

以下のステップでは、DataGrip で FHIR 用の新しいデータソースを作成する方法を説明します。

1. DataGrip で、File -> New -> Project をクリックしてプロジェクト名を入力します。
2. Database Explorer で、プラスアイコン（）をクリックして Driver を選択します。
3. Driver タブで以下を設定します。
   • Name をわかりやすい名前に設定します（例："CData FHIR Driver"）。
   • Driver Files を適切な JAR ファイルに設定します。ファイルを追加するには、プラス（）をクリックし、「Add Files」を選択して、ドライバーのインストールディレクトリ内の「lib」フォルダに移動し、JAR ファイル（例：cdata.jdbc.fhir.jar）を選択します。
   • Class を cdata.jdbc.fhir.FHIR.jar に設定します。
   また、詳細タブでは、ドライバーのプロパティや、VM Options、VM environment、VM home path、DBMS などの設定を変更できます。
   • ほとんどの場合、Expert options で DBMS type を「Unknown」に変更して、ネイティブの SQL Server クエリ（Transact-SQL）を回避してください。これを行わないと、無効な関数エラーが発生する可能性があります。
4. 「Apply」をクリックし、「OK」をクリックして接続を保存します。

FHIR への接続を設定

1. 接続を保存したら、プラス（）をクリックし、「Data Source」→「CData FHIR Driver」を選択して、新しい FHIR データソースを作成します。
2. 新しいウィンドウで、JDBC URL を使用して FHIR への接続を設定します。

   組み込みの接続文字列デザイナー

   JDBC URL の構築には、FHIR JDBC Driver に組み込まれている接続文字列デザイナーを使用してください。JAR ファイルをダブルクリックするか、コマンドラインから JAR ファイルを実行します。

         java -jar cdata.jdbc.fhir.jar
       

   接続プロパティを入力し、接続文字列をクリップボードにコピーします。

   URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。

   汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。

   Service Base URL のサンプル

   • 汎用：http://my_fhir_server/r4b/
   • Azure：https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
   • AWS：https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
   • Google：https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/

   汎用FHIR インスタンス

   CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います（OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください）。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。

   
3. URL を接続文字列に設定します。例：

   jdbc:fhir:URL=http://test.fhir.org/r4b/;ConnectionType=Generic;ContentType=JSON;AuthScheme=None;

4. 「Apply」と「OK」をクリックして接続文字列を保存します。

これで、Data Explorer にデータソースが表示されます。

FHIR に対して SQL クエリを実行

JDBC Driver を介してアクセス可能な FHIR のエンティティ（テーブルとして利用可能）を参照するには、データソースを展開します。

クエリを実行するには、任意のテーブルを右クリックして「New」→「Query Console」を選択します。

Console で、実行したい SQL クエリを記述します。例：

SELECT Id, [name-use] FROM Patient WHERE [address-city] = 'New York'

CData JDBC Driver for FHIR の30日間の無料トライアルをダウンロードして、DataGrip でリアルタイムFHIR のデータを操作してみてください。ご不明な点があれば、サポートチームにお問い合わせください。