HULFT Integrate で FHIR のデータ に接続

HULFT Integrate は、ドラッグ＆ドロップのユーザーインターフェースでコーポレーションフロー、データ変換、処理を簡単に作成できる最新のデータ連携プラットフォームです。CData JDBC Driver for FHIR と組み合わせることで、HULFT Integrate からリアルタイムの FHIR のデータ を扱うことができます。この記事では、FHIR への接続方法と、データを CSV ファイルに出力する手順をご紹介します。

CData JDBC ドライバーは、最適化されたデータ処理機能を備えており、リアルタイムの FHIR のデータ との連携において比類のないパフォーマンスを発揮します。FHIR に対して複雑な SQL クエリを発行すると、ドライバーはフィルタや集計などのサポートされている SQL 操作を直接 FHIR にプッシュし、サポートされていない操作（主に SQL 関数や JOIN 操作）は内蔵の SQL エンジンでクライアント側で処理します。また、動的なメタデータクエリ機能により、ネイティブなデータ型を使用して FHIR のデータ を操作・分析できます。

FHIR へのアクセスを有効化

HULFT Integrate プロジェクトから FHIR のデータ へのアクセスを有効にするには、以下の手順で設定します：

1. CData JDBC Driver の JAR ファイル（およびライセンスファイルがある場合はそれも）、cdata.jdbc.fhir.jar（および cdata.jdbc.fhir.lic）を、Integrate Server の jdbc_adapter サブフォルダにコピーします
2. HULFT Integrate Server を再起動し、HULFT Integrate Studio を起動します

FHIR のデータ にアクセスするプロジェクトの作成

JAR ファイルをコピーしたら、FHIR のデータ にアクセスするプロジェクトを作成できます。まず、Integrate Studio を開いて新しいプロジェクトを作成しましょう。

1. プロジェクト名を入力します
2. 「スクリプトを作成」チェックボックスがオンになっていることを確認します
3. 「次へ」をクリックします
4. スクリプト名を入力します（例：FHIRtoCSV）

プロジェクトを作成したら、FHIR のデータ を CSV ファイルにコピーするためのコンポーネントをスクリプトに追加します。

Execute Select SQL コンポーネントの設定

ツールパレット（Database -> JDBC）から「Execute Select SQL」コンポーネントをスクリプトワークスペースにドラッグします。

1. 「必須設定」タブの接続先で、「追加」をクリックして FHIR 用の新しい接続を作成します。以下のプロパティを設定します：
   • 名前：FHIR Connection Settings
   • ドライバークラス名：cdata.jdbc.fhir.FHIRDriver
   • URL：jdbc:fhir:URL=http://test.fhir.org/r4b/;ConnectionType=Generic;ContentType=JSON;AuthScheme=None;
     
     

     組み込みの接続文字列デザイナー

     JDBC URL の構築には、FHIR JDBC Driver に組み込まれている接続文字列デザイナーをご利用ください。JAR ファイルをダブルクリックするか、コマンドラインから JAR ファイルを実行します。

     		java -jar cdata.jdbc.fhir.jar
     		

     接続プロパティを入力し、接続文字列をクリップボードにコピーします。

     URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。

     汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。

     Service Base URL のサンプル

     • 汎用：http://my_fhir_server/r4b/
     • Azure：https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
     • AWS：https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
     • Google：https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/

     汎用FHIR インスタンス

     CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います（OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください）。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。

     
2. SQL ステートメントを記述します。例：

   SELECT Id, [name-use] FROM Patient

3. 「抽出テスト」をクリックして、接続とクエリが正しく設定されていることを確認します
4. 「SQL を実行して出力スキーマを設定」をクリックします
5. 「完了」をクリックします

Write CSV File コンポーネントの設定

ツールパレット（File -> CSV）から「Write CSV File」コンポーネントをワークスペースにドラッグします。

1. クエリ結果を書き込むファイルを設定します（例：Patient.csv）
2. 「入力データ」を「Select SQL」コンポーネントに設定します
3. SQL クエリで選択した各フィールドのカラムを追加します
4. 「書き込み設定」タブで、「最初の行にカラム名を挿入する」チェックボックスをオンにします
5. 「完了」をクリックします

FHIR フィールドを CSV カラムにマッピング

「Select」コンポーネントの各カラムを、「CSV」コンポーネントの対応するカラムにマッピングします。

スクリプトの完成

「Start」コンポーネントを「Select」コンポーネントに、「CSV」コンポーネントを「End」コンポーネントにドラッグして接続します。スクリプトをビルドして実行すると、FHIR のデータ が CSV ファイルに出力されます。

CData JDBC Driver for FHIRの30日間の無償トライアルをダウンロードして、HULFT Integrate でリアルタイムの FHIR のデータ を活用してみてください。ご不明な点があれば、サポートチームまでお気軽にお問い合わせください。