FHIR のデータでGoogle Sheets を拡張
マクロ、カスタム関数、アドオンを使用してGoogle スプレッドシートからFHIR のデータとやり取りします。CData API Server は、ADO.NET Provider for FHIR（またはその他の250+ ADO.NET Providers）と組み合わせることで、Google Sheets のようなクラウドベースのモバイルアプリケーションからFHIR のデータに接続できるようになります。API Server は、FHIR およびCData ADO.NET Providers にサポートされるすべてのソースのOData サービスを生成する軽量のWeb アプリケーションです。
Google Apps Script（GAS）は、これらのOData サービスをJSON 形式で利用できます。この記事では、Google スプレッドシートにPatient データを取り込みシンプルなアドオンを作成する方法を説明します。
API Server の設定
以下のリンクからAPI Server の無償トライアルをスタートしたら、セキュアなFHIR OData サービスを作成していきましょう。
FHIR への接続
GAS からFHIR のデータを操作するには、まずFHIR への接続を作成・設定します。
- API Server にログインして、「Connections」をクリック、さらに「接続を追加」をクリックします。
- 「接続を追加」をクリックして、データソースがAPI Server に事前にインストールされている場合は、一覧から「FHIR」を選択します。
- 事前にインストールされていない場合は、コネクタを追加していきます。コネクタ追加の手順は以下の記事にまとめてありますので、ご確認ください。
CData コネクタの追加方法はこちら >> - それでは、FHIR への接続設定を行っていきましょう！
-
URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。
汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。
Service Base URL のサンプル
- 汎用：http://my_fhir_server/r4b/
- Azure：https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
- AWS：https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
- Google：https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/
汎用FHIR インスタンス
CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います（OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください）。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。
- 接続情報の入力が完了したら、「保存およびテスト」をクリックします。
URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。
汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。
Service Base URL のサンプル
- 汎用：http://my_fhir_server/r4b/
- Azure：https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
- AWS：https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
- Google：https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/
汎用FHIR インスタンス
CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います（OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください）。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。
API Server のユーザー設定
次に、API Server 経由でFHIR にアクセスするユーザーを作成します。「Users」ページでユーザーを追加・設定できます。やってみましょう。
- 「Users」ページで ユーザーを追加をクリックすると、「ユーザーを追加」ポップアップが開きます。
-
次に、「ロール」、「ユーザー名」、「権限」プロパティを設定し、「ユーザーを追加」をクリックします。
-
その後、ユーザーの認証トークンが生成されます。各ユーザーの認証トークンとその他の情報は「Users」ページで確認できます。
FHIR 用のAPI エンドポイントの作成
ユーザーを作成したら、FHIR のデータ用のAPI エンドポイントを作成していきます。
-
まず、「API」ページに移動し、
「 テーブルを追加」をクリックします。
-
アクセスしたい接続を選択し、次へをクリックします。
-
接続を選択した状態で、各テーブルを選択して確認をクリックすることでエンドポイントを作成します。
OData のエンドポイントを取得
以上でFHIR への接続を設定してユーザーを作成し、API Server でFHIR データのAPI を追加しました。これで、OData 形式のFHIR データをREST API で利用できます。API Server の「API」ページから、API のエンドポイントを表示およびコピーできます。
FHIR のデータを取得する
「Tools」->「Script Editor」とクリックして、スプレッドシートからScript Editor を開きます。Script Editor で次の機能を追加し、スプレッドシートにOData クエリの結果を入力します。
function retrieve(){
var url = "https://MyUrl/api.rsc/Patient?select=Id,Id,[name-use],[address-city]";
var response = UrlFetchApp.fetch(url,{
headers: {"Authorization":"Basic " + Utilities.base64Encode("MyUser:MyAuthtoken")}
});
var json = response.getContentText();
var sheet = SpreadsheetApp.getActiveSheet();
var a1 = sheet.getRange('a1');
var index=1;
var patient = JSON.parse(json).value;
var cols = [["Id","Id","[name-use]","[address-city]"]];
sheet.getRange(1,1,1,4).setValues(cols);
row=2;
for(var i in patient){
for (var j in patient[i]) {
switch (j) {
case "Id":
a1.offset(row,0).setValue(account[i][j]);
break;
case "Id":
a1.offset(row,1).setValue(account[i][j]);
break;
case "[name-use]":
a1.offset(row,2).setValue(account[i][j]);
break;
case "[address-city]":
a1.offset(row,3).setValue(account[i][j]);
break;
}
}
row++;
}
}
次のステップに従って、開いたタイミングでスプレッドシートに入力するインストール可能なトリガーを追加します。
- 「Resources」->「Current Project's Triggers」->「Add a New Trigger」とクリックします。
- 「Run」メニューで「retrieve」を選択します。
- 「From Spreadsheet」を選択します。
- 「On open」を選択します。
ダイアログを閉じると、アプリケーションへのアクセスを許可するように要求されます。
「Publish」->「Test as Add-On」とクリックすることで、スクリプトを確認できます。バージョン、インストールタイプ、およびスプレッドシートを選択し、テストの構成を作成します。作成したら、選択して実行できます。