Node.js で FHIR のデータを MySQL データベースとしてクエリ

Jerod Johnson
Jerod Johnson
Senior Technology Evangelist
Node.js からFHIR のデータに対して MySQL クエリを実行する方法を紹介します。

FHIR 用の ODBC Driver の SQL Gateway を使用すると、MySQL インターフェース経由でFHIR のデータをクエリできます。以下の手順に従って、SQL Gateway の MySQL リモーティングサービスを起動し、Node.js からクエリを開始してください。

FHIR のデータに接続

まだ行っていない場合は、データソース名(DSN)で必要な接続プロパティの値を指定してください。組み込みの Microsoft ODBC データソースアドミニストレーターを使用して DSN を設定できます。これはドライバーインストールの最後のステップでもあります。Microsoft ODBC データソースアドミニストレーターを使用して DSN を作成・設定する方法については、ヘルプドキュメントの「はじめに」の章を参照してください。

URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。

汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。

Service Base URL のサンプル

  • 汎用:http://my_fhir_server/r4b/
  • Azure:https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
  • AWS:https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
  • Google:https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/

汎用FHIR インスタンス

CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います(OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください)。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionTypeGenericに設定する必要があります。

SQL Gateway を設定

SQL Gateway 概要を参照して、FHIR のデータ を仮想 MySQL データベースとして接続を設定してください。クライアントからの MySQL リクエストをリッスンする MySQL リモーティングサービスを設定します。サービスは SQL Gateway UI で設定できます。

SQL Gateway で MySQL リモーティングサービスを作成(Salesforce の例)

Node.js から FHIR をクエリ

以下の例では、mysql モジュールを使用して FHIR への接続を定義し、クエリを実行する方法を示しています。以下の情報が必要です。

  • ホスト名またはアドレス、およびポート:MySQL リモーティングサービスが MySQL 接続をリッスンしているマシンとポート
  • ユーザー名パスワード:SQL Gateway の Users タブで認証したユーザーのユーザー名とパスワード
  • データベース名:MySQL リモーティングサービス用に設定した DSN

以下のコードでFHIR のデータに接続し、クエリの実行を開始できます。

var mysql      = require('mysql');
var connection = mysql.createConnection({
  host     : 'localhost',
  database : 'CData FHIR Sys',
  port	   : '3306',
  user     : 'mysql_user',
  password : 'test'
});
connection.connect();
connection.query('SELECT * FROM Patient', function(err, rows, fields) {
  if (err) throw err;
  console.log(rows);
});

connection.end();

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