Mode で FHIR のデータに基づくデータビジュアライゼーションを作成
Mode は、SQL、R、Python、そしてビジュアルアナリティクスを一つのプラットフォームに統合した協調型データプラットフォームです。CData Connect AI と組み合わせることで、クラウド間で即座にFHIR のデータにアクセスしてデータビジュアライゼーションに活用できます。この記事では、Connect AI で FHIR に接続し、Mode でFHIR のデータに接続してシンプルなビジュアライゼーションを作成する方法を説明します。
CData Connect AI は FHIR 専用のクラウド間インターフェースを提供し、ネイティブでサポートされているデータベースにデータをレプリケートすることなく、Mode でリアルタイムのFHIR のデータからデータビジュアライゼーションを構築できます。ビジュアライゼーションを作成するために、ユーザーはSQL クエリを記述してデータを収集します。最適化されたデータ処理を標準で使用し、CData Connect AI はサポートされているすべてのSQL 操作(フィルター、JOIN など)を FHIR に直接プッシュし、サーバーサイド処理を活用して必要なFHIR のデータを迅速に返します。
Mode 用に FHIR への接続を設定
Mode から FHIR への接続は、CData Connect AI によって実現されます。Mode からFHIR のデータを操作するには、まず FHIR 接続を作成し設定します。
- Connect AI にログインして「Sources」をクリックし、 Add Connection をクリックします
- Add Connection パネルから「FHIR」を選択します
-
FHIR への接続に必要な認証プロパティを入力します。
URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。
汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。
Service Base URL のサンプル
- 汎用:http://my_fhir_server/r4b/
- Azure:https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
- AWS:https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
- Google:https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/
汎用FHIR インスタンス
CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います(OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください)。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。
- Save & Test をクリックします
-
Add FHIR Connection ページの「Permissions」タブに移動し、ユーザーベースの権限を更新します。
Personal Access Token の追加
REST API、OData API、またはVirtual SQL Server 経由でConnect AI に接続する場合、Personal Access Token(PAT)を使用してConnect AI への接続を認証します。アクセス管理の粒度を維持するために、サービスごとに個別のPAT を作成することをお勧めします。
- Connect AI アプリの右上にある歯車アイコン()をクリックして設定ページを開きます。
- Settings ページで「Access Tokens」セクションに移動し、 Create PAT をクリックします。
-
PAT に名前を付けて「Create」をクリックします。
- Personal Access Token は作成時にのみ表示されるため、必ずコピーして安全な場所に保存してください。
接続の設定とPAT の生成が完了したら、Mode からFHIR のデータに接続する準備が整いました。
Mode で FHIR に接続
以下の手順では、Mode からCData Connect AI に接続して新しい FHIR データソースを作成する方法を説明します。
- Mode にログインします
- 画面の左上隅で、名前の横にある下向き矢印をクリックし、「Connect a Database...」を選択します
- 次の画面で「Microsoft SQL Server」を選択します。
- Microsoft SQL Server の資格情報を入力します:
- Display Name: 接続の名前
- Host/Port: Host フィールドに tds.cdata.com と入力し、Port フィールドに 14333 と入力します。
- Database name: 接続したいCData Connect AI データソースの接続名を入力します(例:FHIR1)。
- Username: CData Connect AI のユーザー名を入力します。これはCData Connect AI インターフェースの右上隅に表示されています。例:[email protected]
- Password: Settings ページで生成したPAT を入力します
- ページ下部で「Connect」をクリックして、CData Connect AI に接続できることを確認します。
- 成功すると、以下の画面が表示されます。
これで、Mode で接続を使用できるようになりました。CData Connect AI アカウントから追加のデータソースに接続するには、上記のセットアップ手順を繰り返し、各データソースに対してDatabase の値を変更します。
Mode ビジュアライゼーションの作成
Mode でビジュアライゼーションを作成するには、以下の手順に従います:
- 現在の画面で「New Report」をクリックします。SQL クエリのテキストエディターが表示されます。
以下のクエリを入力します:
SELECT * FROM [FHIR].[Patient];
「Run」をクリックします。アプリにクエリ結果が表示されます:
- クエリを実行すると「New Chart」タブがアクティブになります。このタブをクリックし、「Pie Chart」を選択します。
- 次に、Color セクションにディメンションをドロップし、Angle セクションにメジャーをドロップします。
CData Connect AI を使用して、Mode でFHIR のデータのビジュアライゼーションを作成できました!
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